ШІ-система Google для геному оцінює кожну можливу однобазову зміну
Ars Technica·1 хв читання
У вівторок Google оголосила про AlphaGenome Atlas — ресурс, який намагається передбачити наслідки кожного можливого однонуклеотидного варіанта в геномі людини. Геном людини містить близько 3 мільярдів основ, тож перевірка трьох інших основ ДНК, які не представлені в нашому референсному геномі, означає пропускання через програмне забезпечення AlphaGenome загалом 9 мільярдів основ.
AlphaGenome розроблено для визначення потенційних функцій некодуючої ДНК, яка не кодує білки, але становить переважну більшість геному людини. Частина цієї некодуючої ДНК необхідна для контролю активності білок-кодуючої частини — вона вказує клітині, де й коли виробляти матричні РНК, як обробляти їх до зрілих білок-кодуючих форм тощо. Однак значна її частина, схоже, є не чим іншим, як рештками вірусів та інших молекулярних паразитів.
Можливість визначити функціональну частину дуже корисна, як і проведення всього аналізу одним програмним пакетом. Але доки біологи не почнуть активно ним користуватися (якщо взагалі почнуть), буде незрозуміло, що саме AlphaGenome пропонує понад те, що ми могли б отримати з його навчальних даних.
